肉豆蔻富含豆蔻素、樟脑、龙脑等挥发油，因此富有香气，能祛除鱼肉的腥膻异味，并且对胃肠道有局部的刺激作用，增加胃肠蠕动，促进胃液分泌，增进食欲。豆蔻的提取物能破坏癌细胞外围防护因子，使癌组织容易被损害，从而增强机体对肿瘤的免疫功能。中医还认为，肉豆蔻有温中下气、消食固肠、解酒的作用。
每次2～5克即可。肉豆蔻是温燥的调料，不宜多吃，否则会导致口干、伤肺、损目，如果服用量超过7．5克，可能会引起眩晕，谵妄、昏睡等症状。有实热火邪者忌用。
优质肉豆蔻大都颜色深红，个大坚实，裂为两瓣，露出深红色的假种皮，内有坚硬种皮和果仁。肉豆蔻宜散装或密封袋装注意防雨、防潮。由于是气味强烈的辛香料，保存时应避免与其他香料混放，以免损及风味。
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